《关于复核死刑案件若干问题的规定》在确立核准或者不予核准死刑的裁判原则的同时，在第六条和第七条中分别对一人犯两个以上死罪和一案判处两人以上死刑的案件，保留了核准前提下部分改判的做法。这主要是考虑到，如果对这两类案件一律不予核准，发回重新审判，会导致一个案件反复报核，浪费诉讼资源；会导致案件审理周期大为延长，给司法机关带来较大压力；也会引发法院“玩程序”、“打击犯罪不力”等社会舆论，社会效果不好。同时，死刑复核程序属于一种特殊的“审判”程序，《规定》所保留的改判是核准前提下的部分改判，不同于全案改判，故较之《执行刑诉法解释》第285条的规定，更加符合该程序的性质。此外，保留部分改判，使死刑复核制度的改革较好地建立在以往审判实践的基础上，避免了 “急转弯”，有利于最高人民法院统一行使死刑案件核准权工作实现平稳过渡，也有利于死刑复核制度的改革稳步推进。
依照《规定》第六条，数罪并罚案件，一人有两罪以上被判处死刑，最高人民复核后认为其中部分犯罪的死刑裁判认定事实正确，但依法不应当判处死刑的，可以对该部分进行改判并对其他应当判处死刑的犯罪作出核准死刑的判决，最终核准对被告人的死刑。所谓“依法不应当判处死刑”，其含义同于《规定》第四条的相关表述，指适用法律错误或者量刑不当，不应当判处被告人死刑。例如，被告人甲犯故意杀人罪和抢劫罪，两罪均被判处死刑，数罪并罚决定执行死刑。如果复核后发现原判对故意杀人罪判处死刑正确，认定抢劫罪的事实也清楚，只是定性不准或者根据犯罪的具体情节，依法不应对抢劫罪判处死刑的，则可以直接对该罪的裁判予以改判，然后数罪并罚，核准甲死刑。
依照《规定》第七条，一案中两名以上被告人被判处死刑，最高人民法院复核后认为其中部分被告人的死刑裁判认定事实正确，但适用法律错误或者量刑不当，依法不应当判处死刑的，可以改判并对其他应当判处死刑的被告人作出核准死刑的判决。此类案件中最为典型的是共同犯罪案件。例如，被告人甲、乙、丙、丁等10人组织、领导、参加黑社会性质组织，还犯有故意杀人、绑架等罪，4人均被判处死刑。最高人民法院复核后发现原判对甲、乙判处死刑正确，认定丙、丁的犯罪事实也清楚，但丙、丁的地位、作用低于甲、乙或者根据全案情节不应当判处死刑的，可以对丙、丁进行改判，并核准甲、乙死刑。非共同犯罪案件中，也存在一案判处数人死刑而不应全部核准的情形，这在买卖毒品的双方同时被抓获的贩卖毒品案件中尤为明显。其处理办法也适用《规定》第七条。
在一案判处两人以上死刑的案件中，也会存在部分被告人犯有数罪的情形，这时就要根据案件的具体情况，依据《规定》的有关条款作出相应的处理。如果复核审查时发现一案中未被判处死刑的其他被告人的判决有错误，确有必要纠正的，应当依据刑事诉讼法的有关规定和《执行刑诉法解释》第287条，指令原审人民法院再审。
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