二者特征基本相同，客观上都有假冒行为，主观上都是故意犯罪，目的一般都是为了牟取非法利益，主体相同。二者主要区别表现在：

1、侵害的客体不同。假冒专利罪侵犯的直接客体是国家的专利管理制度，而假冒商标罪侵犯的直接客体是国家的商标管理制度。

2、假冒专利罪的侵害对象不是注册商标，而是被授予的专利。这也是二者在假冒内容上的差别。